南美洲厄瓜多爾西邊外海約1000Km處,位於太平洋赤道正下方的羣島,就是厄瓜多爾的Galapagos羣島。這裏所生產的咖啡稀有,較少在一般消費者間流通。此羣島是被聯合國教育科學暨文化組織(USECO)所認定的自然保護區域,相關法律明文規定整座島嶼不可使用任何化學藥劑或肥料,當然也就被美國的OCIA認定爲有機咖啡的生產地。種植咖啡的區域集中在名叫San Cristobal的島嶼,標高約800——1200m,.由於海島型氣候因素,種植區域長年有濃厚的雲霧覆蓋,並且擁有茂密多樣的植披,被全世界咖啡玩家視爲珍品的加拉帕哥斯咖啡就是種植在此既原始又自然的超完美生態中。根據相關文獻指出,1875年由法國農業學家Don Manual Gobo將Borubon種子帶入此地開啓了Galapagos羣島的咖啡史,曾經有很長一段時間這些咖啡樹在林間閒置,任其生長,直到1990年才由Gonzalez-Duche家族接手重整,目前莊園全名爲“Hacienda El Cafetal San Cristabal”,其所生產的咖啡,從栽種到後製加工處理,都受到嚴格的環保法規規範,年產量大約1150袋(每袋45kg),種植的品種仍爲當年移植來的“老波旁”種。
究其原因,厄瓜多爾絕大多數的咖啡樹均已老化(樹齡約在15 至 80 年間),更糟的是缺乏專業照料。在許多產地,咖啡農在廣闊的林地間散種咖啡,由於雨量不足、也無灌溉系統,加上資金不足,未僱工照料、未能妥善處理蟲害和病變侵害,也未能專業採收。在厄國常見的咖啡蟲害是Broca del Fruto(小食心蟲) 和 Minador de Hojas(斑潛蠅),常見的病變則是Mal de Hilachas(皮棉病)、 roya(鏽班病)、 ojo de gallo(奧霍加洛)和mancha de hierro(鐵班病)。