海拔的高度越高，咖啡豆的質量也就越好，同時，海拔高也是評定標準之一。那咖啡的酸度呢?深烘焙的咖啡豆的酸度比淺烘焙的咖啡豆的酸度要低，比如：巴西咖啡的酸度就比耶加雪菲咖啡的低。

冷萃咖啡對於那些對咖啡敏感的人來說往往效果很好，因爲在數小時的過程中咖啡渣的提取溫度較低。提取咖啡中的一些酸性化合物需要更高的溫度，而冷沖泡時不會發現這些更高的溫度。從廣義上講，較深的烘焙也最適合冷釀，這會進一步降低酸度。

然而在低海拔地區種植的咖啡在生長過程中傾向於產生較少的酸，因此是酸度最低的咖啡。幹（也稱爲“自然”）加工也往往會導致咖啡酸度較低。

除了根據原產地選擇低酸咖啡（即使在一個國家內也有差異），烘焙可以在降低咖啡酸度方面發揮作用。通常來自咖啡中的有機酸，烘烤時間越長會燒掉更多的酸，將它們從咖啡豆中去除，因此沖泡後的飲料也會被去除。

較深的烘焙通常比淺烘焙具有更低的酸度，因爲有機酸在烘焙過程中會被燒掉。

咖啡中與胃部不適相關的兩種主要有機化學物質是 N-烷醇-5-羥色胺和兒茶酚。另一方面，一些化合物，如 N-甲基吡啶鎓 (NMP) 已被證明有助於緩解胃部不適——在較深的烘焙中發現的 NMP 含量高於較淺的烘焙。