咖啡樹是一種常綠喬木，開白色的小花，結綠色的果實，一直到成熟時才轉爲紅色。正常的一株咖啡樹通常可以長到5到10公尺高，不過爲了採收方便，豆農們常將其修剪至2公尺以下。開花後結出一顆顆深綠色橢圓的果實，成熟的果實由深綠轉成鮮紅色，由於色澤與櫻桃相近，故暱稱之「櫻桃」，而每顆「櫻桃」裏又含有一對種子，這對種子就是所謂的咖啡豆。

咖啡花，白色，花冠5裂片，反捲，散發濃烈香氣。樹齡 4~5 年的咖啡樹都會開花，花期約在2~3 月，咖啡花在外觀和氣味與茉莉花相似，開花時緊生於咖啡樹枝呈簇狀。白色的花瓣及清淡的茉莉花香，顯得高貴優雅，但可惜它的花期極短約 3~5 天。因此能夠欣賞咖啡園內咖啡花海的盛況是非常難得的機會。咖啡花開後，便慢慢結成綠色咖啡果實。

未成熟咖啡果實爲綠色，經過 6~7 個月的成熟期後，成熟的果實外皮呈紅色，由於其形狀與顏色與櫻桃相似，因此，外國人稱成熟咖啡果實爲櫻桃 (Cherry) ，在鮮紅的外果皮下，是果皮一種甜甜的黏黃物質包住整個咖啡豆。正常情況下每顆果實有兩粒咖啡豆，扁平面相對，咖啡豆的表面有一層非常薄的隔膜組織─銀皮 (Silver Skin)，每粒咖啡豆與其銀皮皆位於有防護作用的堅硬乳色豆形殼裹，叫內果皮(Parchment)，作用是把咖啡豆和黏液分開。

正常的咖啡樹有時會長出一些較小的果實，裏面只有一粒咖啡豆，這種單粒咖啡豆有不同的名稱，叫圓豆(Peaberry)、或單豆，它不會有扁平的一面，相反的，它的體型較小，且幾乎成圓形。由於其量非常的少，且必須特別的挑選、蒐集在一起，因此，它的價格比平常的咖啡豆高出很多，很多人覺得圓豆的味道特別好，是因其圓形的豆形能將咖啡的原味，緊包密於豆中，味道特爲濃烈。許多咖啡喜愛者，視它爲咖啡豆中的極品。