對於咖啡的特性，醫師們的意見有着很大的分歧，有些醫生認爲咖啡是寒性乾燥的物質，有些認爲是熱性乾燥的物質。

　　還有一些爭論咖啡的果皮和咖啡豆的屬性是不一樣的。

　　1663年歐洲出版的一本玩笑性質的冊子，用現代話來說就是黑色幽默，舉出了很多“咖啡是如何治癒許多醫師認爲無可奈何的病例”的例子。比如雷登的一位愛喝咖啡的本傑明，因他的妻子連着四年都不孕不育而被認爲是性無能，之後他停止了喝咖啡，一年後她妻子便生了一個可愛健康的男孩!我們無法確認大量的咖啡是否會導致不孕不育，但是確實你如果打算要孩子，醫生會和你說“戒菸戒酒戒咖啡”!

　　過度飲用咖啡也引起了醫學界的爭論，所謂“咖啡病”會有以下多種症狀：心情頹廢，精神萎靡不振，感覺稍許麻痹，輕度精神抑鬱症，痔瘡，頭痛，心悸，性慾下降! 對於小孩會造成的負面作用是：導致孩子牙齒鬆動和軟骨病。

　　在日常生活中我們不得不承認有這樣的一羣人在，他們通過一杯咖啡下肚之後就可判別咖啡中羅布斯塔的含量，不同的羅布斯塔所含的比例會導致心慌，脈搏跳動速度上升甚至是嘔吐的反應!

　　醫學界對於咖啡入藥的爭論從它被寫入藥方開始就出現了，時至今天這種爭論仍在持續着!近年來開始流行咖啡減肥，但是各位想要苗條身材的人士們在選擇咖啡減肥的時候還是要考慮一下自己的身體是否喜歡咖啡!