水洗法是目前最流行也是應用最廣泛的生豆處理法，大多數的精品咖啡豆都會選擇水洗法。在南美洲，除了巴西之外的所有國家都會選擇水洗法來處理生豆。

　　水洗法是所有處理方法中科技含量最高的一種處理方法，通過多重的篩選來保證咖啡豆品質的均一穩定。首先依然要將豆子放入水槽內，然後去掉浮起的豆子，將沉入槽底的豆子放入果肉剔除機內。果肉剔除機不但可以剔除掉果肉，更重要的是它巧妙的利用了壓力來將未成熟的豆子徹底的過濾掉。然後會將豆子放入發酵槽內進行最重要的水洗髮酵處理。水洗髮酵的目的是去掉豆子上的果膠，大約需要16到32個小時的發酵時間。在發酵過程中還會產生許多酸性物質，適當的醋酸不僅可以讓咖啡豆更加不易發黴，還會增加咖啡的風味。但是發酵過度的豆子也會被染上酸澀味，從而變成劣質的咖啡。

　　水洗法的咖啡豆含水量一般在16%左右，豆子的品相較好，而且相對的雜味較少，口感清澈，果酸味明亮。