科隆羣島是由四五百萬年前巨大的海底火山噴發形成的，在一百多萬年前浮出海面。島上的火山噴發還時有發生，羣島最西邊的伊莎貝拉島和費爾南迪納島上的火山一直沒消停，最近的兩次噴發是在1995年和1998年。1998年9月，伊莎貝拉島的阿爾塞多（阿爾基多）火山（1097米）爆發，流淌的岩漿進入象海龜的棲息處，厄瓜多爾政府遂出動直升飛機救援，成爲當時的熱門新聞。這裏的火山不高，但面積很大，一座海拔不過千米的火山，直徑能達20千米 科隆羣島由火山堆組成，盾狀火山星羅棋佈；20世紀中有幾個島嶼火山爆發。高高的火山、火山口和巉巖峭壁形成島上崎嶇的地勢。羣島中以伊莎貝拉（又稱阿爾伯馬爾〔Albemarle〕）島最大，長132公里（82裏）左右，佔陸地總面積1/2以上。

二羣島有7個大島

       羣島由7個大島，23個小島，50多個岩礁組成，其中以伊薩貝拉島（IslaIsabela）最大。羣島全部由火山堆和火山熔岩組成，赤道橫貫北部，因受祕魯寒流影響，氣候涼爽並極乾旱，島上有奇特的動物巨龜及大蜥蜴，達爾文1835年曾來此考察加拉帕戈斯羣島（西班牙語：Archipiélago de Colón，臺灣譯爲加拉巴哥羣島）， 正式名稱哥倫布羣島（Archipielago de Colon）。

最初發現這個島時，稱它爲“斯坎塔達斯島”（西班牙語意思爲“魔鬼島”）。因爲島上有許多很大的烏龜，所以後來稱它爲“加拉帕戈斯羣島”（Galapagos Islands），意爲“巨龜之島”。厄瓜多爾共和國統治這些島後，又改名爲“科隆羣島