咖啡果盧旺達咖啡的最大收成季節是在當地的主要雨季間，從三月到五月底。收成季節時，農人們一天中大部分的時間都用在以人工採摘咖啡果。到了下午，農人以香蕉葉編成的傳統籃簍裝着咖啡果到距離數小時遠的清洗站處理。技工以手將品質最良好、帶着深紅色的咖啡果挑選出來，並將剩餘的咖啡果送還農人，在馬拉巴加工區外的市場以低價售出。技工支付農人每公斤0.10美元的報酬。公會每兩星期將報酬存入農人的銀行帳戶。

加工中的水槽技工會立刻進行清洗加工，因爲延誤將會使包覆著咖啡豆的含糖外層發酵，毀了咖啡的口感。咖啡豆首先被丟進一個深水槽中，品質最佳的咖啡果會沒入底部並通過一個褪下外皮的機器。技工將漂浮的咖啡果取出，以相同方式加工後讓合作社於國內市場以較低的價格出售。咖啡豆通過合作社三臺去皮與精選機器，去除外皮與含糖外層，然後讓咖啡豆個別通過震動的濾器。濾器將最高品質的A級豆與那些被列爲B級的分開；兩種等級以1%斜度的水道分別向山丘下運送。運送的過程將各品質的咖啡豆作更進一步的分類，水道底部約有十五個水槽能捕獲不同種類的咖啡豆。咖啡豆在水中持續保存著，A級豆與B級豆分別停留兩天及15-20小時，使其微微發酵，將剩餘糖分轉換，而不嚴重的損害口感。

經清洗的咖啡豆於網架上風乾技工在清洗咖啡豆多次以徹底去除剩餘外皮與含糖外層之後，將咖啡豆放入蔭庇的網架風乾。合作社職員定期將咖啡豆翻轉，同時技工會繼續尋找並挑出品質不佳的咖啡豆。爲期兩週的乾燥過程在陽光下進行着（預備覆蓋物以防下雨），並不停的將咖啡豆翻轉。這個步驟使得咖啡豆裏水的含量從40%降低至12%。

接着，技工將咖啡豆運至奇茲附近的技術中心。有些安裝于山丘上的倉庫內的機器，會除去咖啡豆的角質皮。職員將咖啡豆送至鄰近的研究所，進行最後的品質控制－人工分揀，由數名經驗豐富的婦女執行。在裝袋並根據其品質貼上標籤後，咖啡豆便能於倉庫中儲存以等待上市