危地馬拉位處熱帶，北部及東部沿海平原地區屬熱帶雨林氣候，南部山地屬亞熱帶氣候，一年分乾溼兩季，5-10月爲溼季，11月至次年4月爲乾季。

中部的高原也是危地馬拉的文化中心，在這裏，在1300到1800米高處全年氣溫溫和，日溫度在18到28℃之間，在更高處一月和二月往往會比較冷。東北部年降水量2000-3000毫米，南部爲500-1000毫米，而南部的生態條件非常適合優質的阿拉比卡樹種生長。而更加特殊的是，南部山區分佈着數個活火山，這些活火山至今仍不定期噴發，雖然給當地的人民生活帶去動盪，但其豐富的火山灰土壤也造福了當地的咖啡產業，給咖啡種植帶去了豐富的物質；

且危地馬拉咖啡豆大多屬於阿拉比卡的波旁種，因此危地馬拉的咖啡種植區幾乎都在該國的南部山林地區安提瓜是美洲最古老和最美麗的城市。早在1543年，安提瓜市就是中美洲全體殖民時代的首都，而西班牙總督府亦設置於此。1773年的大地震後，火山曾經將這個原來盛極一時的都城毀滅於瞬間，就在一夕間奪去了所有的繁華與美麗。安提瓜市整個毀滅，所以將首都遷移至危地馬拉市。經過這一場顛躓後的山城，200多年絢爛從此消失，安提瓜再也沒有昂首闊步過。歸於平淡後的安提瓜，如今由僅存着的印第安人刻苦耐勞地經營着。這些勤勞堅強的印第安人成了後來的咖啡生產者，他們不僅發現了安提瓜咖啡濃郁而誘人的獨到氣味，還將它帶給了全世界的人們安提瓜是咖啡的著名產地，豐富的火山土壤，低溼度，強烈的太陽光和涼爽的晚風是安提瓜地區的特色。三座壯觀的活火山──阿瓜（Agua）、雅克提尼瓜（Acatenango）和富埃戈（Fuego）形成一條山谷美景。富埃戈活火山還不時地增添迷濛的塵埃。每隔30年左右，安提瓜島附近地區就要遭受一次火山爆發的侵襲，這給本來就富饒的土地提供更多的氮，而且充足的降雨和陽光使這個地方更適於種植咖啡