印度尼西亞獨立後，先後武裝抵抗英國、荷蘭的入侵，發動了三次獨立戰爭。1947年後，荷蘭與印尼經過多次戰爭和協商，於1949年11月簽訂印荷《圓桌會議協定》。根據此協定，印尼於同年12月27日成立聯邦共和國，參加荷印聯邦。

1950年8月印尼聯邦議院通過臨時憲法，正式宣佈成立印度尼西亞共和國，同一年印尼成爲聯合國第60個成員國。1954年8月脫離荷印聯邦。

1967年，印尼與馬來西亞、菲律賓、新加坡和泰國成立了 “東南亞國家聯盟”（ASEAN，簡稱“東盟”），東盟已經擁有10個成員國，印尼是最具影響力的成員之一。[6] 

1997年亞洲金融危機對印尼造成全面衝擊，引起局勢動盪。

1998年5月，執政長達32年的蘇哈托總統辭職，副總統哈比比接任總統。1999年10月，印尼人民協商會議（簡稱人協）選舉瓦希德爲總統，梅加瓦蒂爲副總統。2001年7月23日，人協特別會議以瀆職罪罷免瓦希德總統職務，梅加瓦蒂接任總統，哈姆扎·哈茲任副總統。

2004年7月，印尼舉行歷史上首次總統直選，原政治安全統籌部長蘇西洛和人民福利統籌部長尤素夫·卡拉（Muhammad Jusuf Kalla）通過兩輪直選勝出，2004年10月20日宣誓就任總統和副總統。

2005年8月，印尼政府與“亞齊獨立運動”分離組織達成和平協議。2006年7月，印尼國會通過亞齊管理法。2006年12月，亞齊舉行地方選舉，前“亞獨運動”領導人伊爾萬迪·尤素夫（Irwandi Yusuf）和穆罕默德·納扎爾（Muhammad Nazar）當選省長和副省長。2012年4月，前“亞齊獨立軍”領導人宰尼·阿卜杜拉（Zaini Abdullah）和穆扎基爾·馬納夫（Muzakir Manaf）當選省長和副省長，任期至2017年。

2006年7月，印尼國會通過新《國籍法》，取消部分帶有種族歧視和性別歧視的內容。2008年10月，印尼國會通過《消除種族歧視法》。[7] 

廢除支那稱呼

2014年3月，印尼總統蘇西洛簽署2014年第12號總統決定書，正式廢除1967年第6號通告，把“支那”(cina)改稱“中華”。1967年第6號通告是印尼前總統蘇哈托時代的產物，包含對中國與華人的國格和人格的歧視與侮辱。當地華人表示，40多年來對中國和華人的歧視稱呼將一去不復返了，這是印尼民主政治進步的體現亞洲咖啡最著名的產地要數馬來羣島的各個島嶼：蘇門答臘島、爪哇島、加里曼島。其中印度尼西亞的蘇門答臘島產的蘇門答臘曼特寧咖啡最享有盛名，它有兩個著名的品名，蘇門答臘曼特寧DP一等和典藏蘇門答臘曼特寧。蘇門答臘曼特寧DP一等餘味長，有一種山野的芬芳，那是原始森林裏特有的泥土味道。其實曼特寧的醇厚，是一種很陽剛的感覺。品質優良的一等曼特寧咖啡酸味很輕，就像花果的微酸。除了印尼咖啡特有的醇厚味道以外，還有一種苦中帶甜的味道，深受喜歡喝濃度烘焙咖啡的人士的喜愛；典藏蘇門答臘曼特寧咖啡之所以稱之爲“典藏”，是因爲它在出口前在地窖中儲藏三年。但典藏咖啡絕不是陳舊的咖啡，而是通過特殊處理的略微蒼白的咖啡，這種咖啡更濃郁，酸度會降低，但是醇度會上升，餘味也會更悠長，還會帶上濃濃的香料味道，有時是辛酸味，有時是胡桃味，有時是巧克力味。 在藍山咖啡還未被發現前，曼特寧曾被視爲咖啡中的極品。非常有趣的一點是，雖然印度尼西亞出產世界上最醇美的咖啡，而印尼人卻偏愛土耳其風格的咖啡。

曼特寧咖啡產於亞洲印度尼西亞的蘇門答臘，別稱“蘇門答臘咖啡”。主要產地有爪哇島、蘇拉威西島及蘇門答臘島，其中90%爲羅布斯塔種。其中蘇門答臘島所產的「曼特林」最爲有名。出產於Sumatra蘇門答臘北部的精緻的傳統阿拉比卡咖啡中最好的被冠以林東Lintong與曼特寧Mandheling出售到市場上。準確地說林東Lintong是指生長在位於林東行政區Toba湖西南部小片區域的咖啡。咖啡小種植區分散在一個高且波浪起伏的充滿蕨被蓋的黏土高原。Lintong林東咖啡非蔭庇種植，不使用化學制品，幾乎完全地由小私有者擁有。Mandheling曼特寧是更加廣泛的稱謂，包含Lintong林東咖啡和相似的條件下的Diari[首府Sidikalang]、Toba湖北部種植區