咖啡樹開花二、三日之後即會凋謝，幾個月後開始結出果實。咖啡花朵爲白色，和茉莉花很像，果實爲核果，直約1.5釐米，最初呈綠色，後漸漸變黃，成熟後轉爲紅色，和櫻桃非常相似，因此稱爲櫻桃咖啡(Coffee Cherry)，此時即可採收。

咖啡果實內含有兩顆種子，也就是咖啡豆。事實上在不同國家及不同地區，咖啡豆採收時間都不相同。採收過程需要大量的人力，特別是高質量特選的咖啡，只能採摘完全成熟的紅色櫻桃咖啡。因爲所有的櫻桃咖啡不是在同一時間成熟，所以需要多次回到同一棵樹去採摘。

一般而言，咖啡豆加工可分二種方式：水洗式和乾燥式。

水洗式wet method

先將咖啡櫻桃外層的果肉除去，然後浸泡在一個很大的盛滿水的水泥槽內。經過發酵處理之後，水洗式咖啡會有一種特有的鮮明清澈的風味。發酵過後的咖啡豆再以清水洗過，然後排除水份再放在陽光下曬乾或是用機器乾燥之。最後用脫殼機將肉果皮和銀皮除去，即可進行篩選並分成不同等級的生咖啡豆。

乾燥式dry method

處理方法是將咖啡櫻桃廣佈在曝曬場上兩個星期，每天用耙掃過幾次，使咖啡豆可以乾的比較均勻。當曬乾之後，咖啡豆會與外皮分開，以脫殼機將幹掉了的果肉，肉果皮去除，然後經過篩選並分成不同的等級。

無論是水洗咖啡，還是乾燥式地加工咖啡，都能生產出優質的咖啡。