2000年，馬拉巴市長向位置鄰近於布塔雷市的盧旺達國立大學（UNR）請求發展援助；隔年，盧旺達國立大學協助成立了聯合加強盧旺達農業合夥計畫（PEARL）。PEARL計劃同時也得到了數個組織的支援：美國國際開發署（USAID）、密歇根州立大學、德州農工大學，另外許多盧旺達組織，包括盧旺達國立大學、國家農業實驗所（ISAR）與吉佳利理工管理學院（KIST）等，亦投入計劃中。2001年二月，PEARL着手與阿巴烏札姆甘比合作改良咖啡品質，以滿足美國專業咖啡市場的標準，進而將咖啡銷往美國。

馬拉巴咖啡農人首要解決的問題是設立一座清洗站。咖啡果在摘取後十二小時內，必須運至清洗站洗去咖啡豆外皮下所被覆的糖，否則咖啡的風味將大爲受損。2001年七月，靠著UNR、盧旺達文化工業部（Office des Cultures Industrielles du Rwanda，OCIR-Café）、ACDI/VOCA與ISAR所資助的資金，他們在塞倫布區（Cyarumbo）靠近主要道路處，建立了第一座清洗站。但清洗站一直遲至收穫季節方纔啓用，因此當年收穫中僅有200公斤（441磅）受到洗淨。然而，結果卻出乎意料的好。2002年清洗站升級，以供應更多咖啡的加工。ACDI/VOCA負責提供資金，修築引入胡葉山（Mount Huye）礦泉水、幫助提高清洗站效率的管線。管線於2002年三月啓用

盧旺達咖啡多爲水洗處理法。水洗處理法首先會將成熟的咖啡果進行清洗和浮選，然後除去外果皮、果肉以及部分果膠層，隨後將咖啡送入發酵池，將剩餘的果膠層發酵去除乾淨再送入晾曬場進行乾燥處理，使水分含量達到約13%。上圖中的咖啡均放置於非洲棚上進行晾曬，以避免咖啡沾染泥土的雜味，晾曬時通風效果更好，規避發黴的情況發生。晾曬過程中咖啡農也會將豆子定期翻動，讓晾曬更均勻，同時會揀選出品質不好的豆子捨棄。

 

 

隨着各方面對盧旺達咖啡的改進和提升，其品質也有了質的飛躍。在08年美國精品咖啡協會SCAA所舉辦的COE大賽中，盧旺達阿諾美加極品水洗波旁，擊敗了牙買加藍山1號和蘇門答臘曼特寧G1特選，衛冕冠軍。盧旺達咖啡以其優良的品質在咖啡世界中爭得了一席之位，贏得了更多的矚目。

 

咖啡果實在採摘後需要儘快運送到處理廠進行處理，但因其國內設施匱乏，無法在第一時間對果實進行處理。果實在被採摘後堆積在一起，因缺乏通風會持續發展加速發黴和腐爛，腐敗的果實會影響咖啡的品質，出現瑕疵風味。

 

而近些年的盧旺達在咖啡的生產加工環節有了很大的進步。首先咖啡果經由人工採摘；全國各地咖啡設立咖啡生產合作社，對咖啡農進行技術上的指導；咖啡農在採摘後儘快送往咖啡處理站進行清洗和篩選，挑選成熟優質的咖啡果進行加工