1808年拿破崙一世侵入西班牙的消息傳到哥倫比亞後，該地人民立即掀起了獨立運動。1810年7月20日，波哥大爆發了大規模反對西班牙殖民統治的暴動，逮捕了新格拉納達總督。1811年11月，各地代表在波哥大組織國會，成立了新格拉納達聯合省政府，並於11月11日宣佈獨立。但是昆迪納馬卡沒有承認這個聯邦。在1812年底，在形成政體的爭論最終導致內戰。1814年又再一次爆發。1815年中，一支大規模的西班牙遠征軍抵達新格林納達。推翻了聯合省政府。16年五月，保皇黨控制了整個新格林納達。1815年西班牙殖民者捲土重來。1819年8月7日，S.玻利瓦爾領導起義軍在博亞卡戰役大敗西班牙殖民軍，10日攻克波哥大，從此結束了西班牙的殖民統治20世紀初，哥倫比亞經濟有所發展，咖啡和石油產量增加,紡織業和食品業發展起來,交通運輸也有所改進。1903年11月，美國策動巴拿馬脫離哥倫比亞獨立（見巴拿馬獨立）。與此同時，美國和英國大量投資於哥倫比亞的石油、鐵路以及咖啡、香蕉種植園，大肆掠奪哥倫比亞的財富。1929年資本主義世界經濟危機爆發後,哥倫比亞的咖啡和石油出口減少，人民生活更加困苦。1930年 7月，哥倫比亞共產黨成立。同年，自由黨人E.奧拉亞·埃雷拉當選總統（1930～1934在任）。

自由黨再度執政後，在人民的壓力下實行了一些改革。A.洛佩斯·普馬雷霍第一次執政期間，於1936年修改憲法：明確三權分立原則,實行直接選舉;廢除天主教會對教育的壟斷；規定工人有權罷工，有選擇職業的自由；政府承認農民佔領私人荒地的所有權，規定工人的最高工作日和失業補助。第二次世界大戰期間，由於工業品進口減少,咖啡輸出增多,哥倫比亞的工農業都有所發展,國家黃金儲備增加,工人階級隊伍不斷壯大。1941年12月太平洋戰爭爆發後，哥倫比亞與日本斷交，1943年11月對德宣戰