另外，咖啡種植的環境問題，雖然可以達到熱區標準，但遠離赤道，蒸發量問題，還有大規模雲南咖啡種植地不足海拔1100m，最近幾年雲南大旱，以及產區的霜期問題等，都讓咖啡的種植無法正常保證，直接影響了出品質量。至於其它加工問題、咖農素養問題就更不多說了，茶農世代喝茶，但咖農可能一輩子也沒有喝過咖啡。

說這麼多，但也不代表沒有喝過杯品上好的雲南咖啡，後期加工製作烘焙做的好的話，像這裏有位朋友說的普洱曼老江、曼中田的卡杜拉以及保山潞江百花嶺的鐵皮卡、赧抗的波本等幾個山頭的咖啡還是不錯的，特別赧抗，海拔1800m的老品種雲南可以說是現在唯一還在大面積種植阿拉比卡的省份，主要種植地又集中在滇西保山德宏臨滄和滇南普洱版納，19世紀傳教士傳進來的咖啡以羅布斯塔爲主，後沒有再進行大規模種植，上世紀50年代，蘇聯援助的專家把世界主流的2個阿拉比卡品種：鐵皮卡typica以及波本bourbon帶到了雲南保山進行培育和推廣，得到了好評，後由於特殊時期，科研種植趨於停滯，改革開放以後在當地農業專家的努力下，保山國營潞江農場和新城青年農場培育的鐵皮卡變種還在國際咖啡大賽上獲得過第一名，好評如潮，但國人對咖啡的認知，使得我們並沒有提高太多的種植興趣。90年代初開始，爲了提高咖農的種植積極性，保山熱作所引進了葡萄牙咖啡鏽病研究中心用Timor（中粒，蒂姆）和Caturra（小粒，卡杜拉）雜交培育的卡蒂姆品種，並掛上了無數頭銜進行推廣種植至今，這個品種很好的解決了病蟲災害以及抗旱等諸多因素，重要的是畝產提高了接近一倍，雖然提高了咖農的種植積極性，但這也成爲了雲南咖啡從此品質低下的原因；同時期，雀巢、麥士威爾進入中國，開始在普洱等地推廣了適合速溶咖啡的咖啡品種：S288，大粒種小粒種天然雜交以及印度阿拉比卡肯特kent雜交後代S26自育，一流的抗鏽病能力，但種植難度及適應能力較低，20世紀初開始基本停止種植