以含量來排序，(咖啡中)可溶解於水的因素的典型值爲：酚醛聚合物 (果肉) 8%，多糖6%，綠原酸4%，礦物質3%，水2%，咖啡因1%，有機酸0.5%，糖0.3%，油脂0.2%，以及芳香(物質)0.1%。

　　咖啡因對精神的影響已經有很詳細的文獻介紹了，而且大多數“民間知識”把咖啡的效果等同於咖啡因了，儘管如此，其它的，咖啡中更豐富的成份尚未得到廣泛的研究。

　　咖啡生豆含有最高可達10%的綠原酸，即，奎寧酸(一種常見的植物成份)的不同種的羥基酯異構體。常見於大多數植物和水果，咖啡生豆可包含多達10%乾重量的綠原酸。這些是單酯，雙酯，三代，四羥基苯乙烯酸以及奎寧酸的混合物，一種類糖的分子。(譯註：這段嚴重頭暈... 希望有化學專業的朋友指正。)

　　在烘焙過程中，大約半數的綠原酸會失掉一個水分子，並與內酯結合，形成一個一種奎寧內酯的混合物。

　　烘焙好的咖啡的衝煮過程導致奎寧的異構化。這會形成數千種不同的化合物，每種都會有它獨有的藥理學作用。儘管這些化物物很少能佔到咖啡乾重量的0.3%以上，但卻有可能會對咖啡的作用起到顯著的影響，因爲這些化合物具有能夠進入大腦的能力(突破腦屏障?)。此外，不同種奎寧的相互作用，作用於同樣的生物對象，會帶來健康的咖啡效應。綠原酸或是奎寧的藥理學效果大部分是未知數。有趣的是，之前的一份澳大利亞的報告指出，240毫克研磨的咖啡(大約一杯160毫升咖啡含量的1/5)，置換了50%的安眠系統受體烯丙羥嗎啡酮(嗎啡拮抗藥)。這提示我們，咖啡的這種要素可能會與大腦的安眠系統相結合，而這與情緒調節相關，也與酒精中毒及毒癮有關。