這種方法使咖啡豆具有柔和的酸味與平和的苦味。巴西、埃塞俄比亞、也門等地運用此法。缺點：易受天氣影響，次品豆和異物混入的機會多。所以在發貨前須細心地挑選一遍。

　　水洗式，將收穫的果實倒入水槽中，去掉漂浮物，將水中的果實移至果肉去除機內，剝離外皮和果肉，然後再放回水槽，除去漂浮物，將水中"果核"倒入發酵槽，浸泡半天或一天，除去發酵豆表面的膠體，水洗，曬乾或機械乾燥，在脫殼機上脫除內果皮，即成商品生咖啡豆了。

　　水洗式的優點：咖啡豆光澤好，混入異物少，酸味稍好些。哥倫比亞、墨西哥、危地馬拉等國採用這種方法。用水洗式生產的咖啡豆幾乎佔咖啡豆總產量的70%。

　　有時發酵時間處理不好會產生髮酵臭和特殊的酸味;處理得好，可形成咖啡豆個性化的香味。這時的咖啡豆，已可裝入麻袋送到各地，或裝入特殊的集裝箱漂洋過海了。

成熟的咖啡漿果外型像櫻桃，呈鮮紅色，果肉甜甜的，內含一對種子，也就是咖啡豆（Coffee Beans）。咖啡品種有小粒種、中粒種和大粒種之分，前者含咖啡因成分低，香味濃，後兩者咖啡因含量高，但香味差一些。世界銷售的咖啡一般是由小粒種和中粒種按不同的比例配製而成，通常是七成中粒種，主要取其咖啡因；三成小粒種，主要取其香味。每個咖啡品種一般都有幾個到十幾個變異種。咖啡比較耐陰耐寒，但不耐光、不耐旱、不耐病。咖啡含有咖啡鹼、蛋白質、粗脂肪、粗纖維和蔗糖等九種營養成分，作爲飲料，它不僅醇香可口，略苦回甜，而且有興奮神經、驅除疲勞等作用。在醫學上，咖啡鹼可用來作麻醉劑、興奮劑、利尿劑和強心劑以及幫助消化，促進新陳代謝。咖啡的果肉富含糖份，可以製糖和制酒精。咖啡花含有香精油，可提取高級香料