選豆：先將咖啡果實放入大水槽內，把沉入水槽的紅色果子和半青半紅的果子移入果肉篩出機，去除果肉，雜質。

刨除果膠：取出咖啡豆，不需拿去曬，更不需要倒入水槽發酵，而是直接倒入旁邊的果膠刮除機，只需少量的水便能以機械力刮除粘答答的果膠屑。

暴曬：然後取出表面光滑的生豆，拿到戶外暴曬，直到含水量降至12%就可入倉。

發酵：黏膜的附着力很強，並不容易去除，必須放在槽內約18~36小時，使其發酵，並分解黏膜。發酵的方法有兩種，即溼式發酵與乾式發酵，顧名思義，前者加水，後者不加水。發酵的過程中，種子與內部的果肉會產生特殊的變化，這是水洗法中最影響咖啡風味的一個步驟。有些農場會添加熱水或酵素，以加快發酵的速度，這對品質會有負面的影響，並不受精選咖啡愛好者歡迎。巴布亞新幾內亞的Sigri是著名的咖啡農莊，以獨特的水洗法自豪，她們的發酵期維持3天，每隔24小時用乾淨的水清洗一次，因此才能生產出相當好喝的Sigri Coffee

乾燥：經過水洗之後，這時，咖啡豆還包在內果皮裏，含水率達50%，必須加以乾燥，是含水率降到12%，否則將繼續發酵，變黴腐敗。較好的處理方法是使用陽光乾燥，雖然得費時1~3個星期，不過，風味特佳，相當受到喜愛。另外，有些地方使用激起乾燥，大量縮短處理時間，使得風味不如陽光乾燥的咖啡。前面所提到的Sigri農莊便是利用赤道熾熱的太陽來曬乾咖啡豆，難怪它的Sigri Coffee在精選咖啡市場上贏得相當多的讚美