在所有咖啡的產量中，阿拉比卡種咖啡佔據了70%-80%，它絕佳的風味和香氣使其成爲所有咖啡原生種中唯一能夠直接飲用的咖啡。但是它對於乾燥、霜害、病蟲害等的抵抗力過低，特別不耐咖啡的天敵--葉鏽病，因而各產地國都在致力於品種的改良。

　　

　　阿拉比卡種(Coffea arabica)的原產地是埃塞俄比亞的阿比西尼亞高原（Abyssinia，現稱埃塞俄比亞高原），初期主要作爲藥物食用（伊斯蘭教的僧侶們用來當作治療身心的祕藥或者用來醒腦），13世紀培養出烘培飲用的習慣，16世紀經由阿拉伯地區傳入歐洲，進而成爲全世界人們共同喜愛的飲料。

　　

　　原生種

　　

　　原來世界上的商品咖啡都是小粒咖啡，只是到了19世紀末因爲葉鏽病的肆虐導致大量咖啡莊園的倒閉，種植者纔開始尋找其他抗病的品種。

　　

　　小粒咖啡仍然是最主要的咖啡品種，約佔世界咖啡總產量的3/4。主要在拉丁美洲各國種植，也有部分在印度尼西亞和太平洋島嶼種植。世界最大的咖啡產地巴西的地理氣候條件非常適合小粒咖啡的生長，種植的主要咖啡品種也是小粒咖啡，巴西的咖啡產量佔世界總產量的1/3以上。

　　

　　小粒咖啡的果實比中粒咖啡和大粒咖啡要小，漿果橢圓型，一般內有兩粒種子，即所謂的“咖啡豆”。

　　

　　亞種

　　

　　小粒種咖啡阿拉比卡種（Coffea arabica）系列中三個出現較早的亞種是：藍山亞種（varietal BlueMountain），鐵比卡亞種（varietal Typica）以及波旁種（varietal Bourbon）。

　　

　　牙買加藍山是品質極佳的咖啡；鐵畢卡咖啡原產於埃塞俄比亞及蘇丹的東南部，是西半球栽培最廣的咖啡變種；在夏威夷產量較高的夏威夷可那（Kona）和藍山咖啡在質量上不相上下，在價格上也只有1~3美金的差距。

　　

　　波旁種是十八世紀由法國移民從波邦島（Island of Bourbon，今天的法屬留尼旺島Island of Reunion，位於馬達加斯加島東邊的印度洋中）傳入美洲，如今在巴西等西半球產地廣泛種植，在中國雲南也有少量種植。波邦亞種的咖啡因含量比鐵畢卡亞種高20%~30%，但是要少於絕大多數咖啡亞種。主枝最初和主幹呈45度向上生長，隨果實負荷下垂。側枝節部較密、結果多、產量較高，但漿果較小，成熟較快，因此不耐強風及大雨。波邦咖啡是小粒咖啡中僅次於鐵畢卡的變種，結果多，產量較高，但漿果較小，成熟較慢。中國雲南種植的小粒咖啡主要是鐵畢卡亞種和波邦亞種，從咖啡的植物學角度來講，雲南小粒咖啡和公認最優秀的牙買加藍山(Jamaica Blue Mountain)、夏威夷可那(Kona)有基因上的相近性。