咖啡屬的染色體基數X=11，除阿拉伯種(Coffea arabica L.)爲2n=44屬於異源四位體外，其餘都是2n=22。目前，人們研究最多，已經人工馴化而大面積栽培的僅限於真咖啡這一組的小粒種(即阿拉伯種)和中粒種(即甘佛拉種C. canephora也稱羅巴斯塔Robusta)，而大粒種(C. liberica)和迪瓦利(C. dewevrei)僅有少數國家少量栽培。

　　咖啡主要栽培種類及品種

　　1.阿拉伯種(Coffea arabica L.)

　　在我國稱爲小粒種。原產於非洲埃塞俄比亞西南部和蘇丹東南部的海拔1000-2000m之間，經人工引種栽培後，已遍佈全世界熱帶地區，是世界主要栽培種，種植面積與產量分別佔世界總面積及總產量的80%和82%以上。分佈於北緯28度至南緯38度之間的高海拔(1300—1900米)地區。主要產區是拉丁美洲，其中以巴西最多，其次是哥倫比亞，東、西非洲都有較大面積的栽培。我國雲南、廣西、福建、粵西、海南等省區都先後引種栽培成功。我國除海南以外栽培小粒種爲主，雲南栽培的咖啡亦爲小粒種。

　　阿拉伯種咖啡(小粒種)爲常綠灌木，植株較矮小，高4—5米，分枝細長(0.7—0.85米);葉片小而尖，呈長橢圓形，較硬，葉面革質，葉緣波紋細而明顯;頂芽嫩葉綠色或古銅色，因此雲南稱爲“綠頂咖啡”與“紅頂咖啡”;單節結果數一般爲12—20個，多者達25個以上;枝條結果節較多時，果實較小，果肉較甜，種皮較厚，易與種子分離。鮮果與幹豆比(以下稱鮮幹比)約爲4.5-5：1，種子較輕，每公斤幹豆4000—5000粒，但不同種植區每公斤幹豆數不同。在管理良好條件下，其產量不亞於中粒種。較耐寒，耐旱;一般品種易感葉鏽病及易受天牛危害。自然壽命可達100年，但經濟壽命約在25年左右。產品氣味香醇，飲用質量佳。

　　這個種由於變異類型豐富，經人工選擇後，已從選育出以下具有栽培價值的變種或品種。

　　鐵畢卡變種(C arabica var. typica Cramer) 原產於埃塞俄比亞及蘇丹的東南部，西半球栽培是廣。結果多，漿果大，成熟早，產量高，植株較健壯，成齡樹形圓錐形，嫩葉嫩葉古銅色，葉片較狹窄，不耐強光照，易發生枯枝病。

　　波邦變種(C arabica var. bourbon Choussy) 原產於布隆迪，是阿拉伯咖啡中栽培面積僅次於鐵畢卡的變種。側枝節間密，結果多，產量高，漿果小，成熟晚。嫩葉淡綠色，耐光，適於高海拔無廕庇的環境。在巴西表現高產，故已逐漸取代了鐵畢卡。

　　卡杜拉變種(C arabica var. caturra KMG) 波邦變種的一個單基因突變種，起源於巴西。是一高產的品種，植株樹型較矮，只有1.2米高，無需廕庇。但需要肥沃的土地和細緻的修剪，抗病力差。

　　蒙多諾沃栽培種(Mundo Novo cultivar) 起源於巴西，是由波邦與鐵畢卡的高產品系天然雜交後代中選出的高產品種，產量比波邦與鐵畢卡都高，但果實較小，且往往有不飽滿或不稔實的現象。

　　肯特種(Kent) 原產印度，是1911年由肯特(L. D. Kent)在自己的咖啡園中發現培育出來的高產品種，表現生勢旺盛，對鏽病和綠介蟲有抗性，已在印度廣泛栽培。

　　S288 源於印度，由小粒種與大粒種咖啡的天然雜種與Kent種雜交後代S26自交育成。該品種具有抗咖啡鏽菌Ⅱ號小種的能力，在國內曾一度大面積推廣，因適應性較差，現已不推薦種植。

　　SLN9 是埃塞俄比亞野生小粒種與抗鏽的蒂汶島雜種再雜交選出的品種，表現抗鏽強，耐旱，產量高。

　　K7 肯尼亞主要商業栽培種，源於Kent種，適宜在中低海拔種植，不抗鏽，但抗咖啡枯腐病。

　　蒂汶島種(Hibrido de Timor) 源於蒂汶島，是小粒種與中粒種天然雜交種，是帶有一個穩定的抗咖啡漿果病和葉鏽病基因的抗原品種。

　　SL28 肯尼亞主要的商業栽培種，主要種植在中海拔地區，品質好，但不抗鏽病。

　　SL34 肯尼亞主要的商業栽培種，主要種植在中高海拔，隆雨量多的地區，不抗鏽，但品質優良。

　　卡杜拉(Caturra) 巴西選育的波邦變種，不抗鏽，矮生高產，產量比鐵畢卡高。曾在巴西和哥倫比亞大面積種植，目前新種植較少。

　　魯伊魯-11(Ruiau-11) 肯尼亞咖啡研究所用SL28和SL34與抗咖啡苦腐病(CBD)的品種Rume sudan和抗鏽矮生產產品種經單交或復交選育出的F1代優良品種，其適應性廣，在肯尼亞已大面積推廣種植。

　　2.羅巴斯塔種(C. robusta)

　　又稱甘佛拉種(C.canephora)，俗稱中粒種，原產於非洲剛果熱帶雨林區，栽培面積僅次於小粒種，分佈於南北緯10度之間的低海拔(900米)地區。主要產區爲東南各國，印度及非洲中部和東部。我國主要在海南省栽培。

　　此種爲常綠小喬木，植株中等，株高5—8米，主幹粗壯，枝幹木栓化較遲，分枝細長而柔軟，結實後下垂。葉片長而大，呈橢圓形，皺軟而薄，葉緣波紋大而明顯，葉脈密。葉片有光澤，先端尖。枝條結果多，單節結果25—30個。果實形狀因類型不同而異，扁圓形或橢圓形，成熟時紫紅色、深紅色。果皮、果肉及種皮均較薄。鮮幹比約爲3.5-5.1：1。漿果汁液較少，種皮與果皮不易分離。種子差異較大，每公斤幹豆2600—5600粒。不耐強光，需要廕庇，根淺不耐旱，需要較高的溫度，抗寒力最弱，但抗鏽病力最強和較少受天牛危害，產量較高。產品飲用味濃而香，刺激性強。

　　本種主要的栽培品種有(Quillon)、烏干達種(Uganda)以及近年來科迪瓦選育出10箇中粒種無性系107、126、182、197、461、477、503、505、149、400。其149和400較而旱。

　　3.利比里亞種(C. liberica)

　　又稱大粒種。原產於非洲利比里亞，世界栽培面積較小，分佈於利比里亞、馬來西亞、印度、印度尼西亞等國。適宜在低海拔地區種植。爲常綠喬木，植株高大，高達10餘米，主枝與主幹成銳角斜向上方生長，枝條粗硬，枝幹木栓化最快。葉片大，呈橢圓或長橢圓形，革質，厚硬而有光澤，葉緣波紋極小。葉脈稀。枝條結果少，一般3—6個，果實大，着生稀疏，單位面積產量低，但單植產量高。果實大，長圓形，成熟時硃紅色，果皮及果肉硬而厚。鮮幹比爲7-10：1，每公斤幹豆1300—2600粒，種子外殼厚而硬。主根深，較耐旱，抗風，耐光，成齡樹不用廕庇，抗寒力中等，最易感染葉鏽病。產品味濃烈較苦，刺激性強，飲用品質差，但可與其它咖啡混合加工，提高飲用質量。

　　主要品種有埃塞爾種(C. excelsa)。1905年在非洲剛果的查理河(Chari)被發現，故又有稱爲查理種。