收成果實後到出貨上市前要先去除外皮、果肉、賽果皮及銀皮。其方法有乾燥式(也稱天然法或非水洗式)與水洗式兩種。
乾燥式：
咖啡豆
精選咖啡豆圖冊
外形的判斷
美味的咖啡，從其煎焙後咖啡豆的形狀即可知曉，如下圖所示。當然不能有不良的咖啡豆混入，更要注意的是正常的豆也會摻雜入優質的咖啡豆而造成妨礙。一顆可沖泡出美味咖啡的煎焙豆，首先必須是豆大肥美，而且縐折均勻，其次是大小一致且無色無斑。這些是視覺判別的要點，如果細心去看，應不難分辦。
不良豆種類
發酵豆採收前掉落土中發酵的咖啡豆。發黴的異味，會對咖啡美味造成莫大的影響。
死豆又稱未熟豆，或受氣侯因赤的影響，發育不健全。煎焙後會產生煎斑，使咖啡有股青澀味。
黑豆發酵豆，已腐敗、變黑的咖啡豆。因爲是黑色，一眼即可與正常的咖啡豆區分出來。
蛀蟲豆受蟲侵害的咖啡豆。殘缺豆可能是作業時卡到，或是搬運中處理不慎，造成咖啡豆的殘缺。會造成煎焙時有煎斑，且會產生苦味及澀味。
其它殘留薄皮的豆、發育不良的豆、乾燥不完全產生黴味的豆、只有外殼的(貝殼豆)
咖啡豆 - 採摘
咖啡豆
咖啡豆圖冊
經過3～4年的生長，咖啡樹日漸成熟，開始結果，果實會沿着樹枝排成串或簇擁成一團。我們看到的咖啡豆就是咖啡樹結的籽。籽的外面是一層果皮，隨着咖啡豆的成熟，果皮會由綠變紅，一變紅就可以採收了。咖啡果實的結構一般是外果皮下面有一層果肉（中果皮），裏面是一個小薄層，再往裏是一層像羊皮紙一樣的物質——內果皮。在所有這些果皮的裏面通常有兩粒平面相對的豆子，豆子外面有一層薄膜或外皮。
阿拉比卡種咖啡豆的成熟期是6～8個月，羅百氏特種咖啡豆是9～11個月。
不同地區收穫時期也各不相同，赤道以北一般在9～11月份收穫一次。赤道以南主要一次是在4月或5月，但可以持續到8月份。部分赤道地區的國家則可以全年收穫。所以一年的多數時候都可以有新收的咖啡豆。
採摘咖啡時一般有兩種方式。一種是成片採摘，也就是無選擇的採摘，這種方式如果條件允許也可以用機械化的方式採摘。另一種是有選擇的採摘，勞動量較大，採摘成本高，只運用於阿拉比卡種，水洗處理的阿拉比卡種咖啡豆。
生產方法
收成果實後到出貨上市前要先去除外皮、果肉、賽果皮及銀皮。其方法有乾燥式(也稱天然法或非水洗式)與水洗式兩種。
乾燥式
方法較爲單純。首先將剛採下的果實廣佈在曬場上一兩個星期，直到果實發出霹啪的聲音爲止，自然乾燥之。之後，以脫殼機將幹掉了的果肉、內果皮和銀皮去除。
以這種方式精製而成的咖啡豆，呈微酸而略有苦味。幾乎所有巴西產的咖啡豆、埃塞俄比亞、也門等地之咖啡豆都豆以這種方法取得的。這種方法的缺點是容易受天氣的影響，以及易摻入瑕疵豆和其它雜質。因此，必須細心地加以篩選才行。
水洗式
即將收成的果實放入流動的水槽，除去浮在水面的果實之後，以果肉去除機剝除外皮和果肉。再放入水槽，將浮出的果肉去除。之後，移入發酵槽，浸泡半天至一天，再將發酵的咖啡豆表面上的膠質溶掉。
再以水洗過後，曬乾數日後以機器乾燥之，最後用脫殼機將內果皮去除，即成爲可作爲商品的生咖啡豆。用這種方式，會比干燥式的咖啡豆色澤較美，且雜質也較少。哥倫比亞、墨西哥、危地馬拉等國70%左右的產量都採用此方法。
方式對比
咖啡豆採收後就進行了處理程序，否則會開始發酵，使咖啡豆產生異味。處理的方法主要是“乾燥式”和“水洗式”兩種，這兩種方法會造成不同的風味。乾燥式的豆子有完整的自然醇味、溫柔的香氣與較多的膠質；水洗式則有不錯的醇味、高度的香氣和活潑的酸味，它也是濃縮咖啡裏甜味的來源
