德國化學家弗裏德里奇·費迪南·龍格是第一個分離出咖啡因並說明其不良影響的人，從那時起，咖啡因就引起了咖啡飲用者、醫生和科學家們的擔心。然而，最初研究的重點是關於飲用過量咖啡因對健康的不利影響，幾乎沒有對攝入適量咖啡(不是單純的咖啡因)給健康帶來的積極影響進行評估。1819年，年輕的龍格開始進行化學實驗，並發現了顛茄提煉物對眼睛的影響。1820年，龍格把他的發現告訴給他的好朋友歌德，歌德鼓勵他對咖啡進行分析。幾個月後，龍格首次提煉出了咖啡因。喬安·沃爾夫岡·歌德是德國詩人、小說家、人道主義者、理論家、畫家和政治家，酷愛喝咖啡。歌德的影響遍及歐洲，在之後的整整一個世紀中，他的作品是音樂、戲劇、詩歌和哲學的主要靈感源泉。因爲歌德的鼓勵，咖啡因才得以被人類發現。

　　咖啡因是食品中被研究得最徹底的成分。咖啡因對人體健康影響的研究已經很充分。現代科學幾乎知道咖啡因的所有優缺點，但是咖啡與人類健康的關係卻知之甚少。過去的研究認爲，咖啡對人體健康非常有害，因爲它含有咖啡因。幾乎在發表過的每一篇有關咖啡的科技文章中，焦點都是咖啡因含量和提純咖啡因對人或動物的影響。咖啡因被認爲是咖啡裏主要的精神刺激成分，但事實並不是這樣。今天，每個有學識的醫生、科學家、咖啡飲用者都可以完全肯定攝入適量咖啡因(最多500毫克)是安全的，相當於3-4杯咖啡中的含量。每天攝入500-600毫克則會有一定的健康風險。1987年，美國食品和藥物管理局(FDA)重新確認了它的積極作用。科學試驗表明，碳酸飲料裏的咖啡因對人體沒有任何副作用。美國國家科學院、科學研究理事會和外科醫生辦公廳報道，攝入適量咖啡因與增加健康危險性之間無相關性。經常喝咖啡的人突然停止攝取咖啡因可引起輕微的戒斷症狀(例如睏倦或偶爾頭痛)，但不會出現上癮行爲。咖啡因檸檬酸鹽作藥用時的劑量是20毫克/千克，用於治療早產兒窒息。咖啡因也用於緩解脊髓穿刺後頭痛和偏頭痛。