收穫是在一年裏不同的月份(取決於生產國的地理位置)，視果實的成熟情況而進行。收穫時間取決於地理位置、氣候和海拔高度，按各個生產國的各自情況而改變。

　　成熟的果實可用手採摘，或用小耙子耙，要不就用杆打落到地上：前兩種方式可用低成本的勞工實施，他們會較有選擇性地操作;用杆打的方式比較快捷但不夠精細，並且要求對果實作進一步的清理。地形條件允許的話，收穫可使用特別的自動機器來操作。

　　由於咖啡是一種非常嬌嫩的產品，豆必須在收穫後的幾天內加工。這是爲了防止果肉和覆蓋的薄膜發酵。種子的加工有兩種方式：

　　“幹”處理，加工出被稱爲“自然”咖啡;這種方式主要在巴西和西非被採用。果實鋪在地上通過日曬使其乾燥，並不斷地翻動，使果實均勻地接受太陽光線的照射，持續15至20天的週期。

　　“溼”處理，這個方式要求更高且更困難。用這種加工方法可得到被成爲“水洗的”或“柔和的”咖啡。這種方式在中美洲、墨西哥、哥倫比亞、肯尼亞和坦桑尼亞等國被採用。加工步驟是：果實清潔，浸泡，去除果肉，發酵，乾燥和去皮，並最後去除殘留的雜質，以及把豆拋光。

　　然後，豆被裝入麻袋，通常稱重60公斤(大約132磅)，接着儲藏在特別的有遮蔽的房屋裏。它們將開始自己的旅程——從麻袋到包裝袋——通往消費國。