按照以前的說法，喝咖啡是有害於健康的，至少是害多於益。然而至今爲止，全世界的人都在高度讚揚咖啡："咖啡是最佳提神劑。"咖啡一詞的原意就是"精神充沛"。西方人離不開咖啡，1700年的時候，倫敦有3000家咖啡館，當時倫敦的人口只有60萬，也就是說，平均200人有一家咖啡館。對咖啡的評說主要是圍繞咖啡因的："咖啡容易使人上癮，容易引起心肌梗死和腦溢血，對染色體有害，會導致發胖……"

警告咖啡因的文件記錄最早產生於1911年，也就是有關部門控告美國可口可樂公司，說這種新飲料可能對健康有害的那一年，然而可口可樂公司贏了那場官司。但是事情並沒有了結，20世紀70年代開始了真正的反咖啡浪潮。當時許多研究者提出，咖啡因和心臟病、膀胱癌有關。加利福尼亞的一位毒理學家說，他曾爲咖啡工業當了四分之一世紀的顧問，見過四五千份批評咖啡和咖啡因的文章，在那些文章中，幾乎把咖啡說成了和每一種疾病有關的飲料。

其實，人類消費咖啡因的歷史已有8000年了。可以說，最近的研究結果對咖啡簡直是一次平反，它們表明了咖啡和咖啡因是健康的。健康到什麼程度?有人說，如果我們不從咖啡中獲得咖啡因，那我們就得往飲用水中摻入咖啡因。

有24份研究報告指出，喝咖啡者得大腸癌的可能性小於25%。另有一些研究表明，喝咖啡者得肝癌和B型糖尿病的可能性較小。最近甚至有科學家指出，咖啡因能推遲早老性癡呆以及酒精性肝損害的出現。科學界特別強調，這一系列的研究都不是咖啡種植者或咖啡生產者贊助的，而是由美國健康研究所出資進行的一個大型健康研究項目的副產品。由於咖啡的利尿作用，咖啡還能使人減少得腎結石的機會。咖啡對某些人來講還是一種溫和的抗抑鬱劑，能把人從自殺的念頭中拉回來，不過關於這一點，科學家們認爲，要搞清其中的機制，尚需10至20年。

大部分人都把咖啡當作一部僅僅生產咖啡因的機器，其實咖啡含有2000種左右化學物質。咖啡之所以有抗癌效果，是因爲咖啡中含有一組抗氧化劑，它們通常也存在於紅(葡萄)酒、巧克力、茶和其他水果、蔬菜中。常用飲料的咖啡因含量大致如下：過濾咖啡每200毫升含140毫克、濃縮咖啡(Espresso)每60毫升含100毫克、速溶咖啡每200毫升含80毫克、紅茶每200毫升含80毫克、綠茶每200毫升含40毫克、黑巧克力每30克含35毫克、可樂每330毫升含32毫克、無咖啡因咖啡每200毫升含6毫克、咖啡因片劑每片含20-200毫克。

西方成人平均每天攝入的咖啡因約爲280毫克，作爲長期習慣飲咖啡的西方人，他們主張每天喝咖啡不超過4杯。在其他國家，則控制在2至3杯比較合適。儘管對咖啡和咖啡因的評價發生了根本性改變，但咖啡仍然不宜長期大量飲用，高血壓病人、老年婦女、孕婦、兒童、胃病患者更應謹慎一些。