院分四級：最高法院、高級法院、一審法院和調解法院。各級法官均通過全國或地方法官委員會考覈推薦，由總統任命。最高法院院長從大法官中選舉產生，任期2年。現任最高法院院長恩裏克·門多薩(Enrique MENDOZA)。

國家檢察院爲獨立機構，檢察長由最高檢察團選舉產生，任期3年，可連選連任一次，但第二任期不得超過2年。現任國家檢察長何塞·安東尼奧·貝拉埃斯(José Antonio PELAEZ)。審計署爲獨立機構，審計署長由政府提名，國會任命，任期7年。現任國家審計署長福阿德·埃里亞斯·科裏(Fuad Elías KHOURY)。[12] 

政府

內閣由部長會議主席和18名部長組成。總統主持部長會議並任命內閣。現任內閣成員爲：部長會議主席胡安·費德里科·希門內斯·馬約爾(Juan Federico JIMÉNEZ Mayor)，外交部長拉斐爾·龍卡利奧洛·奧韋戈索(Rafael RONCAGLIOLO Orbegoso)，國防部長佩德羅·阿爾瓦羅·卡特利亞諾(Pedro Alvaro CATERIANO)，經濟和財政部長米格爾·卡斯蒂利亞·魯維奧(Miguel CASTILLA Rubio)，內政部長威爾佛雷德·佩德拉薩·謝拉(Wilfredo PEDRAZA Sierra)，外貿和旅遊部長何塞·路易斯·席爾瓦(José Luis SILVA)，司法部長埃達·阿德里亞娜·裏瓦斯(Eda Adriana RIVAS)，教育部長帕特里西婭·薩拉斯·奧布林(Patricia SALAS O´brien)，衛生部長克里斯蒂娜·德阿比奇·羅斯皮利奧斯(Cristina DE HABICH Rospigliosi)，農業部長米爾頓·馬丁·馮·埃塞(Milton Martin VON HESSE)，勞動和促進就業部長何塞·比列納·佩得羅西諾(José VILLENA Petrosino)，生產部長格拉迪斯·特里維里奧(Gladys TRIVEÑO)，能源和礦業部長豪爾赫·梅里諾·塔夫爾(Jorge MERINO Tafur)，交通和通訊部長卡洛斯·帕雷德斯·羅德里格斯(Carlos PAREDES Rodríguez)，住房、建設和用水部長雷內·科爾內霍·迪亞斯(René CORNEJO Díaz)，婦女部長安娜·哈拉·貝拉斯克斯(Ana Jara VELÁZQUEZ)，環境部長曼努埃爾·普爾加·比達爾(Manuel PULGAR Vidal)，文化部長路易斯·佩拉諾(Luis PEIRANO)。