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在人類悠久歷史中，咖啡確實曾被當成藥物使用，卻沒有咖啡能預防疾病的說法。常見咖啡業者大多宣傳豆種產地、烘焙、選豆方式、及咖啡的香氣口感等詞語，卻鮮少提及咖啡對人體健康益處相關資訊。
舉例來說，咖啡是維生素 B2 優質的來源之一，同時也富含許多的植物化學物質（phytochemicals）：
綠原酸（chlorogenic acid）是咖啡主要的多酚類抗氧化物質
奎寧酸（Quinic acid）是造成咖啡略帶酸味的成分
咖啡醇（cafestol）及咖啡豆醇（kahweol）爲一種雙萜化合物，常見於未經過濾的咖啡中
天然的興奮劑咖啡因（caffeine）則作用於人體中樞神經
咖啡烘焙時產生的 N-methylpyridinium（NMB）可以強化其他植化素作用。
以咖啡與健康爲主題的相關研究，從古至今發表篇數超過 1,000 篇，早期研究發現飲用咖啡可能提高某些癌症發生率，近期大型且研究架構完整的研究則發現，其實適量飲用咖啡是可以預防癌症的發生，如肝癌和子宮內膜癌。實驗性研究亦發現到類似的成果，如咖啡因會刺激腸道，加速其蠕動，縮短致癌物職停滯腸道時間，進而有助於預防結腸直腸癌發生。
每日飲用咖啡的人較不易罹患特定的疾病
影響咖啡因萃取的原因很多，包括咖啡豆種類、研磨顆粒大小、衝煮方法、浸泡時間、溫度高低等因素，咖啡豆品種更是影響咖啡因含量的重要因素，本文將幫助讀者認識飲用咖啡的好與壞。
1. 提高認知能力
咖啡可以立即也可以漸進的影響人類的認知與情緒，研究發現固定且微量到中量的咖啡因攝取（約 30 – 300 mg），在靜止活動狀態下，可以強化警覺以及反應時間。
而在活動的情形之下，如學習、決策、開車以及飛行員飛行狀態，有著正向的效果。對於老年人而言，長期習慣飲用咖啡，有助於增加短期記憶的效果。
2. 減緩頭痛
早有一段時日使用咖啡因單獨或搭配藥物治療疼痛，在隨機試驗的研究結果發現，咖啡因搭配鎮痛解熱藥（Aspirin, Acetaminophen and caffeine），其緩解頭痛的效果較單獨使用 Acetaminophen 或低劑量 Ibuprofen 佳。但也有研究發現咖啡因與慢性偏頭痛及鎮痛型頭痛發生有關。
3. 減少帕金森氏症風險
部分研究發現長期飲用咖啡者可能與帕金森氏症低罹患率有關，但其中的作用機制尚未清楚。
值得注意是，喝咖啡預防帕金森氏症並非適用於每個人，如正在接受賀爾蒙治療之更年期女性，若每天飲用咖啡超過6杯者，其相對風險是提高的。
4. 降低阿茲海默症風險
部分研究有發現到固定飲用咖啡者可能與降低阿茲海默症罹患風險有關，在動物實驗結果中亦有類似發現。
5. 降低心臟血管疾病風險
低到中度飲用咖啡（每日最多 3 杯）可以預防心肌梗塞。
雖然長期飲用咖啡非心血管疾病致病因子，但需留意的是過量飲用咖啡是有可能誘發動脈硬化以及心律不整情形的發生。
6. 改善糖尿病患胰島素抗性
研究顯示咖啡因攝取可以降低胰島素抗性以及改善葡萄糖耐受。在部分前瞻性研究亦有獲得類似結果，咖啡與茶中的咖啡因，可以提高糖尿病病友胰島素敏感性以及改善飯後血糖偏高情形。
7. 改善便祕
咖啡因具有刺激腸胃平滑肌蠕動的效果，因此達到解便祕功效。
8. 降低酒精型肝硬化以及 C 型肝炎感染風險
美國一項大型研究發現，咖啡攝取與酒經型肝硬化罹患機率呈負相關，亦與慢性 C 型肝炎進展速度減緩有關。
9. 睡眠障礙、焦躁、恐慌與反社會行爲
咖啡因攝取與焦慮、緊張、失眠以及煩躁有關。美國一項研究指出，受試者爲 3,600 對雙胞胎，測試結果發現每天飲用至少 5 杯咖啡以上的咖啡重度依賴者，其咖啡因攝入量與廣泛性的焦慮、抑鬱、恐慌以及反社會行爲和藥物濫用情形有關。
日常應避免飲用組合咖啡，建議選購少磅數現烘的咖啡豆。
諸多科學研究顯示咖啡豆富含抗氧化劑以及對健康有益的營養素，其中核黃素、維生素 B5、錳、鉀、鎂及維生素 B3 等的營養素確實與身體健康有著某種程度的幫助，每日飲用咖啡的人較不易罹患特定的疾病，但仍應掌握喝咖啡的最佳時間，並視個人身體狀況適量飲用，或選擇低咖啡因品項，預防咖啡因攝取過量導致心悸等不舒服、不適應的等情形。
此外日常應避免飲用組合咖啡，如市售即溶咖啡、三合一咖啡、罐裝咖啡，請選購少量或少磅數現烘的咖啡豆，以確保咖啡的好品質才能守護健康。
任何東西都有正面與負面的效果，爲提供讀者在品嚐咖啡香氣與滋味的同時，有更多管道接觸正確的咖啡資訊兼顧身體保健，下一回主題將與讀者聊聊‘咖啡與癌症預防’相關議題。
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