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咖啡豆分爲三原種系統
阿拉比卡咖啡豆又稱 阿拉伯咖啡豆
羅布斯塔咖啡豆又稱 剛果咖啡豆
利比亞咖啡豆又稱 利比里亞咖啡豆
全世界現今咖啡約有一百多種
普通栽培種多屬三原種系統及若干雜交種
三原種可細分爲數十種品種
咖啡豆因此依品種、產地、品牌的不同會有各自不同的特性
阿拉比卡咖啡豆，佔世界總產量76﹪
羅布斯塔咖啡豆，佔世界總產量約20﹪
利比里亞咖啡豆，除少數生產國自己消費外，只有歐洲有人飲用
臺灣咖啡最早引進即爲阿拉比卡咖啡，目前大面積栽培的也是阿拉比卡咖啡
“咖啡品種”近期被咖啡使用者、烘焙業者或是玩家關切，但大都不深入、執著，因業者關心價錢與銷售通路；玩家把重心投注烘焙技巧的改進。會正視“咖啡品種”多半是農業學者、植物學者、咖啡農以及喜好精品咖啡（Specialty Coffee）的咖啡愛好者。隨近年國人對於精品咖啡文化提升，自家烘焙者日益增加，咖啡貿易不再是大盤商的生意，逐漸出現小衆集資直接向產地購買生豆或是加入國際生豆競標活動，咖啡品種也漸漸地受到購買者的關注。
咖啡屬於茜草科咖啡屬的常綠灌木，咖啡屬分支下的植物約四十多種，其中具有商業價值的咖啡只有三種---阿拉卡種（Coffea Arabica）、羅布斯塔種（Coffea Robusta） 【注1】利比里亞種（Coffea Liberica），這三個品種稱“咖啡三大原生種”。阿拉比卡種佔世界生產總比例約70~80%精品咖啡需求大宗；羅布斯塔種佔20~30%主要用於即溶、罐裝咖啡，咖啡因含量是阿拉比種的二倍；利比里亞種由於不耐葉鏽病且風味差，只在西非蘇里南、利比亞、科特迪瓦等國內交易買賣，並不盛行於世界各地。
咖啡在生長過程中受到許多挑戰，如潮溼、霜害、病蟲害…等，其中以“葉鏽病”傷害最大。自然萬物在物競天擇下會進行演化，咖啡樹也是如此，因此本文提到的“鐵比卡種”、“波旁種”等屬生物分類學“界、門、綱、目、科、屬、種”中的“種”之下，向下依序分類可分爲“次種”、“變種”及“品種”，其中有屬於自然演化出現的突變品種，也有人爲刻意培育爲特殊需求的品種。一般市面上常看到的阿拉比卡種只是概略的說法，實際品種沒有細分，只能知它們的祖先是阿拉比卡種。
以下介紹由阿拉比卡種演變的品種
【Typica】鐵比卡種
最接近原生種品種。豆型稍長像被拉長的雞蛋，在中美洲有Arabigo或criollo的稱呼。有乾淨檸檬酸味、餘韻甜、對葉鏽病扺抗力低照顧不易，結實量低加上收成期長（每2年收成一次） 產量少。
【Bourbon】波旁種
Typica突變來的次種，與Typica同是目前最接近原生種的品種。在馬達加斯加島旁的Reunion（原來地名爲Bourbon）發現。有些咖啡專家認爲Bourbon只不過是Typica的自然變種，沒什麼特別的！但其實Bourbon有屬於自己的特色，與Typica同樣有優質口感似紅酒的酸味、餘韻甜，從咖啡樹葉子與豆貌分辨Typica與Bourbon，Bourbon葉子較寬大，結實咖啡櫻桃較小，生成較密集，因此豆貌相對於Typica較小、較渾圓。在肯尼亞及坦桑尼亞利用Bourbon進行人工混種，出現“SL28”及“SL34”人工新品種，因風味表現優而出名。Bourbon結實量雖比Typica高，但收成期同是2年，也算是產量少的品種。
【Caturra】卡杜拉種
Bourbon 的突變種。最早在巴西被發現，1937年在巴西Minas Gerais開始種植商業利用。口感上帶檸檬或柑橘的酸味，在甜度方面不及Typica與Bourbon，因爲Caturra的甜度是決定於栽種者施肥的次數與劑量，擁有高產能，但要維持產能必須持續施肥與剪枝，因此樹株矮且分枝多。雖產能提高，但因爲收成期需要2年與照料成本較高，使得產量還是有所受限。
【Mundo Novo】蒙多諾渥種
Typica與Bourbon混種。樹株高三米以上，使採收不易。口感上缺乏甜味且後段有苦味出現。優點是耐蟲病害有高產能，爲高產量品種。
【Catuai】卡圖艾種
Caturra與Mundo novo交配種，Caturra的樹株矮而Mundo novo的樹株高，混種之後改良高度較方便採收。口感普通，甜度表現與Cattura類似，施肥技術有很大的關聯。種植密度較高，適當地施肥就能擁有高產能，樹株耐操，能扺抗風雨摧殘，收成期短只要1年，但缺點是壽命短，只有10年。
【Maragogype】馬拉嘎吉坡種
Typica 變種。在巴西Bahia名爲Maragogype的地方發現，豆子顆粒大有象豆之稱。口感溫和帶微微酸甜，建議淺烘焙，因深烘焙無法表現特色。產量很少。
【Pacamara】帕克馬拉種
Maragogype與Pacas混種，是Maragogype的兄弟。
【Pacas】帕克斯種
Caturra與Bourbon混種。
【Catimor】卡帝莫種
【注2】Timor與Caturra混種。1959年在葡萄牙被發現。口感明顯容易分辨，苦酸帶點澀味，餘韻有鹹味。種植密度高，葉鏽病的扺抗力強，爲高產量的品種。
【Geisha】藝妓種
Geisha是巴拿馬特有的咖啡種，近年在精品咖啡大放異彩，問市短短几年間就有”精品皇后”之稱，算是巴拿馬咖啡的寶石，目前產量少價格高，咖啡農稱近年才發現但事實不是如此，Geisha不但早在1960年就已出現在巴拿馬，1931年，在埃塞俄比亞西南部就被發現，在當地有許多不一樣的稱呼，如Gesha。1931、1932年，分別以Abyssinian及Geisha的名稱進口至肯尼亞。1936年，肯尼亞將收成的Geisha種子拿到烏干達及坦桑尼亞種植。1953年七月，坦桑尼亞將子樹株送到哥斯達黎加，母株留在自己國家。1960年，透過【注3】CATIE巴拿馬正式培育Geisha。Geisha香氣佳，餘韻甜且乾淨、有特色、果實味，帶明亮的果實酸味，如芒果、木瓜，口感非常柔順，可與埃塞俄比亞水洗豆相比。
【注1】羅布斯塔種（Coffea Robusta）事實上是剛果種（Coffea Canephora）的突變品種。
【注2】Timor是阿拉比卡種與羅布斯塔種的交配種，葉鏽病的扺抗力強。
【注3】CATIE-Tropical Agronomic Center for Research and Education
阿拉比卡品種 細分類…
在《精品咖啡》的世界裏，目前只就美味的阿拉比卡品種進行分類及討論
較具代表性的品種有：
古老原生種：Heirloom （祖傳優良品種）、Typica （鐵比卡）、Bourbon （波旁）
Typica變種：Maragogype （巨型象豆）， Geisha （暱稱 藝妓豆… 因與【藝妓】同音） 等…
知名 Bourbon變種：Caturra （卡杜拉）， Pacas （帕卡斯） 等…
知名混血品種：例如 Pacamara （帕卡斯 + 巨型象豆 = 帕卡瑪拉）
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