醫學界逐漸擔心低因咖啡殘留的苯,會對人體造成傷害。化學家又研發出沒有安全顧慮的萃取溶劑二氯甲烷、乙酸乙酯。二氯甲烷的好處是沸點很低,加溫到攝氏四十度就揮發掉。美國食品暨藥物管理局(Food and Drug Administration)經過多年檢驗,於一九八五年通過二氯甲烷爲合法的咖啡因萃取溶劑。至於乙酸乙酯則更安全,因爲有些水果所含的乙酸乙酯還高於低因咖啡的殘留量,也被美國列爲合法萃取液。溶劑萃取法可分爲直接與間接兩種方式。但兩種方法的前置作業相同,都必需先進行軟化處理,即咖啡豆以高壓高溫蒸過,豆表膨脹,和液體接觸面積因而增加,然後再置入二氯甲烷或乙酸乙酯溶劑,萃取出咖啡因,這叫做直接法,也就是羅塞魯斯採用的方法,所不同是萃取液,過去使用有毒的苯,而今採用安全的二氯甲烷或乙酸乙酯。別一種間接式萃取法,即咖啡豆經過軟化處理,置入溫水中,豆內的咖啡因和其他成分溶入溫水中,此時的溶液幾乎成了咖啡精華液,然後再導入另一容器,加入二氯甲烷或乙酸乙脂,把咖啡因萃取出,稍微加熱咖啡因就會隨着萃取溶液蒸發掉。最後,再把不含咖啡因的精華液導入先前被溫水萃取的咖啡豆,重新吸收或回補流失的成分。一般而言,間接式萃取法會喪失較多的咖啡風味,不如直接萃取法理想。